懷孕時發現幽門螺桿菌感染，如果沒有癥狀，根除治療建議推遲到分娩后。

如果存在由幽門螺桿菌感染引起的消化性潰瘍，主要是抑酸治療，根治幽門螺桿菌的治療也應推遲到分娩后。

但如果幽門螺桿菌感染引起嚴重的惡心、嘔吐等癥狀，根據需要在與患者及家屬交待根除的必要性及副作用后，也可以在孕14周后進行針對幽門螺桿菌的治療，可選擇懷孕期間可使用的低危藥物，如克拉霉素、阿莫西林等。

在哺乳期，也根據需要選擇對嬰兒安全的藥物，如克拉霉素、阿莫西林，而不建議使用對哺乳期嬰兒可能不安全的藥物，如鉍劑，甲硝唑和左氧氟沙星。